稅務(wù)機(jī)關(guān)有根據(jù)認(rèn)為納稅人有稅務(wù)違法行為，或者預(yù)先通知有礙檢查的，稅務(wù)機(jī)關(guān)可能在書面通知的同時(shí)實(shí)施檢查。出現(xiàn)這樣的情況，企業(yè)在積極配合稅務(wù)機(jī)關(guān)做好納稅檢查的同時(shí)，要正確運(yùn)用法律賦予納稅人的權(quán)利，來維護(hù)自己的正當(dāng)權(quán)益。
    一、實(shí)施稅務(wù)檢查時(shí)，稽查人員應(yīng)當(dāng)2人以上并出示稅務(wù)檢查證，同時(shí)送達(dá)《稅務(wù)檢查通知書》，填制文書送達(dá)回證。要是檢查金融、軍工、尖端科學(xué)等保密單位時(shí)，還應(yīng)出示《稅務(wù)檢查專用證明》。
    二、實(shí)施稅務(wù)檢查，需到被查單位開戶銀行查詢被查對象存款帳戶時(shí)，稽查人員應(yīng)憑縣以上稅務(wù)局局長審批的《稅務(wù)機(jī)關(guān)檢查納稅人、扣繳義務(wù)人存款帳戶儲(chǔ)蓄存款許可證明》，到銀行支行級會(huì)計(jì)部門辦理簽字手續(xù)后辦理有關(guān)手續(xù)。需查詢稅務(wù)違法案件涉嫌人員的儲(chǔ)蓄存款，須經(jīng)設(shè)區(qū)的市以上稅務(wù)局局長批準(zhǔn)。
    三、實(shí)施稅務(wù)檢查時(shí)采取詢問方式的，必須有2名以上稽查人員參加，稽查人員詢問當(dāng)事人、證人和利害關(guān)系人，要事先向被詢問人送達(dá)《詢問通知書》，同時(shí)填制文書送達(dá)回證，詢問過程中不得對當(dāng)事人和證人引供、誘供或逼供。詢問調(diào)查時(shí)，應(yīng)有專人記錄，并制作《詢問（調(diào)查）筆錄》，并在詢問前告知被詢問人不如實(shí)提供情況、做偽證、假證應(yīng)承擔(dān)的法律責(zé)任。詢問調(diào)查時(shí)，可根據(jù)實(shí)際情況責(zé)令當(dāng)事人，就有關(guān)涉稅事宜填寫《稅務(wù)案件當(dāng)事人自述材料》，并由其在自述材料中簽章、押印。調(diào)查詢問結(jié)束后，《詢問（調(diào)查）筆錄》應(yīng)交被詢問人核對，被詢問人沒有閱讀能力的，應(yīng)當(dāng)向被詢問人宣讀，核對無誤后，由被詢問人簽章、押印，被詢問人拒絕的，應(yīng)當(dāng)注明。如果筆錄有差錯(cuò)、遺漏，允許被詢問人更正或補(bǔ)充，核對無誤后，再由被詢問人在改動(dòng)和補(bǔ)充處簽章、押印。
    四、實(shí)施帳務(wù)檢查時(shí)，原則上應(yīng)在納稅人的業(yè)務(wù)場所進(jìn)行，當(dāng)然也可以責(zé)成納稅人將帳簿、記帳憑證、報(bào)表和其他有關(guān)資料攜帶到稽查局接受檢查。必要時(shí)可采取調(diào)帳檢查，由稽查人員持局長審批的《調(diào)取帳薄資料通知書》送達(dá)被查單位，填制文書送達(dá)回證，將被查對象的帳簿、記帳憑證、報(bào)表和有關(guān)資料調(diào)回稽查局檢查。調(diào)取帳薄資料時(shí)，必須向納稅人開具《調(diào)取帳簿資料清單》。調(diào)取被查對象以前年度的涉稅資料，應(yīng)在三個(gè)月內(nèi)退還。調(diào)取被查對象當(dāng)年涉稅資料的，須經(jīng)設(shè)區(qū)的市以上的稅務(wù)局局長批準(zhǔn)，并在30日內(nèi)退還。
    五、調(diào)查取證過程中，需要取得證據(jù)原件的，可向當(dāng)事人開具《提取證據(jù)專用收據(jù)》；不能取得原件的，可以復(fù)印、復(fù)制或照像，但必需注明原件的保存單位（個(gè)人）和出處，由原件保存單位和個(gè)人簽注“此件由我單位（個(gè)人）提供，與原件核對無誤”字樣，并由其簽字、押印。要將空白發(fā)票調(diào)出查驗(yàn)時(shí)，使用局長審批的《調(diào)取空白發(fā)票收據(jù)》；確需對已使用的發(fā)票進(jìn)行查驗(yàn)，并作為重要證據(jù)材料使用時(shí)，憑局長審批的《發(fā)票換票證》辦理相關(guān)手續(xù)。
    六、如納稅人存在拒絕檢查人員檢查、稅務(wù)稽查實(shí)施部門發(fā)出《限期提供資料通知書》后拒絕提供財(cái)務(wù)資料、稅務(wù)稽查實(shí)施部門發(fā)出《詢問通知書》后拒絕接受詢問情況的，經(jīng)縣以上稅務(wù)局局長批準(zhǔn)后，稅務(wù)稽查實(shí)施部門可以要求公安機(jī)關(guān)協(xié)助檢查。