老師們，我們是一個新開的村辦企業(yè)（小規(guī)模納稅人），村經(jīng)濟聯(lián)合社是唯一的股東，基本上所有的支出都是由村經(jīng)濟聯(lián)合社出錢然后實物給到企業(yè)。我想問一下，超過注冊資本的部分怎么做處理？