上市公司組織機構的特別規(guī)定主要包括以下幾個方面：
1. 獨立董事制度：上市公司應當設立獨立董事，獨立董事應當具有獨立性，不得與上市公司或其附屬企業(yè)存在直接或間接的利益關系。獨立董事的職責包括對公司事務進行獨立判斷，保護中小股東的權益等。
2. 董事會秘書制度：上市公司應當設立董事會秘書，負責公司股東大會和董事會會議的籌備、文件保管以及公司股東資料的管理，確保公司信息披露的及時性、準確性、完整性和公平性。
3. 監(jiān)事會制度：上市公司應當設立監(jiān)事會，其中至少包括一名職工代表。監(jiān)事會的職責包括監(jiān)督董事會和高級管理人員的行為，檢查公司財務，以及審議公司的重大事項等。
4. 股權激勵計劃：上市公司可以實施股權激勵計劃，包括股票期權、限制性股票、股票增值權等，以激勵公司董事、高級管理人員和核心技術（業(yè)務）人員。
5. 關聯(lián)交易審議程序：上市公司與關聯(lián)方之間的交易應當遵循公平、公允的原則，并履行相應的審議程序和信息披露義務。
6. 信息披露制度：上市公司應當建立完善的信息披露制度，及時、真實、準確、完整地披露公司信息，包括定期報告（如年度報告、半年度報告）和臨時報告（如重大資產(chǎn)重組、關聯(lián)交易、業(yè)績預告等）。
7. 內幕交易禁止：上市公司董事、監(jiān)事、高級管理人員和持有公司5%以上股份的股東及其一致行動人，不得利用內幕信息進行交易。
8. 投資者關系管理：上市公司應當建立投資者關系管理制度，通過多種渠道與投資者進行溝通和交流，提高公司透明度，增強投資者對公司的了解和信心。

這些規(guī)定旨在確保上市公司的運營透明、公平和有效，保護投資者權益，尤其是中小股東的權益。