企業(yè)實行“營改增”后，與原營業(yè)稅會計核算不同的是，增值稅屬于價外稅，即無論是銷售商品、提供勞務(wù)收到的銷項稅額還是購進商品、接受勞務(wù)支付的進項稅額，都必須在銷售價款之外單獨核算。這種價外稅的會計核算方法可以根據(jù)企業(yè)增值稅業(yè)務(wù)的繁簡區(qū)分3種方法，即，簡易核算法、二級賬戶核算法和三級賬戶核算法。其中，三級賬戶核算法更適用于增值稅業(yè)務(wù)多且項目比較復(fù)雜的大中型企業(yè)一般納稅人。

三級賬戶核算法，是指增值稅核算在“應(yīng)交稅費”總賬（一級）科目下設(shè)置“應(yīng)交增值稅”、“未交增值稅”、“增值稅檢查調(diào)整”和“抵扣進項稅額”等二級明細科目，分別核算應(yīng)交增值稅、未交增值稅、增值稅檢查調(diào)整和抵扣進項稅額等。

在“應(yīng)交增值稅”二級科目下再設(shè)置“進項稅額”、“已交稅金”、“減免稅款”、“出口抵減內(nèi)銷產(chǎn)品應(yīng)納稅額”、“轉(zhuǎn)出未交增值稅”、“銷項稅額”、“出口退額”、“進項稅額轉(zhuǎn)出”、“轉(zhuǎn)出多交增值稅”等科目。

三級明細科目核算方法適用于增值稅業(yè)務(wù)多且項目比較復(fù)雜的大中型企業(yè)一般納稅人。其賬簿格式應(yīng)采用多欄式明細賬。在這種方法下，各二級科目的核算內(nèi)容為以下4點。

第一，“應(yīng)交增值稅”二級科目，借方記錄企業(yè)購進貨物或接受勞務(wù)支付的進項稅額、已交增值稅、減免稅款、出口抵減內(nèi)銷產(chǎn)品應(yīng)納稅額和月未轉(zhuǎn)出當月應(yīng)交未交增值稅；貸方記錄企業(yè)銷售貨物或提供勞務(wù)收到的銷項稅額、出口退稅、進項稅額轉(zhuǎn)出和月未轉(zhuǎn)出多交增值稅；期末借方余額，反映企業(yè)尚未抵扣的增值稅。

第二，“未交增值稅”二級科目，借方記錄企業(yè)月末時轉(zhuǎn)入的多交的增值稅；貸方記錄企業(yè)月末時轉(zhuǎn)入的當月應(yīng)交未交增值稅；期末借方余額反映多交的增值稅，貸方余額反映未交的增值稅。

第三，“增值稅檢查調(diào)整”二級科目，是根據(jù)國家稅務(wù)總局《增值稅日常檢查辦法》的規(guī)定，一般納稅人在稅務(wù)機關(guān)對其增值稅納稅情況檢查后涉及增值稅賬務(wù)調(diào)整而設(shè)置的專門科目。

檢查后，按應(yīng)調(diào)減的進項稅額或調(diào)增銷項稅額、進項稅額轉(zhuǎn)出的金額，借記有關(guān)科目，貸記應(yīng)交稅費——增值稅檢查調(diào)整；按應(yīng)調(diào)增的進項稅額或調(diào)減銷項稅額、進項稅額轉(zhuǎn)出的金額，借記應(yīng)交稅費——增值稅檢查調(diào)整，貸記有關(guān)科目；全部調(diào)賬事項完成后，應(yīng)結(jié)出該賬戶的余額并分別四種不同情況進行處理。

余額在借方時，應(yīng)全部視同留抵進項稅額，轉(zhuǎn)到“應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅（進項稅額）”科目。

余額在貸方，且“應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅”無余額時，應(yīng)全額結(jié)轉(zhuǎn)到“應(yīng)交稅費——未交增值稅”科目。

若該科目余額在貸方，“應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅”科目有借方余額且多于該貸方余額時，將該科目貸方余額全部轉(zhuǎn)到“應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅（銷項稅額）”科目。

若該科目余額在貸方，“應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅”科目有借方余額但小于這個貸方余額，應(yīng)將該貸方余額先沖轉(zhuǎn)“應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅”科目，剩余部分再轉(zhuǎn)入“應(yīng)交稅費——未交增值稅”科目。

第四，“待抵扣進項稅額”二級科目，是“營改增”一般納稅人在輔導(dǎo)期內(nèi)所設(shè)置的專用科目。該科目用于核算輔導(dǎo)期一般納稅人取得尚未進行交叉稽核比對的已認證專用發(fā)票抵扣聯(lián)、海關(guān)進口增值稅專用繳款書、廢舊物資普通發(fā)票以及貨物運輸發(fā)票等的進項稅額。具體會計處理如下：

在輔導(dǎo)期一般納稅人取得規(guī)定扣稅憑證時：

借：應(yīng)交稅費——待折扣進行稅額

    貸：有關(guān)科目

在經(jīng)過交叉稽核比對無誤后：

借：應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅（進項稅額）

    貸：應(yīng)交稅費——待折扣進項稅額

經(jīng)核實不得抵扣進項稅額時，用紅字編制一張沖銷憑證：

借：應(yīng)交稅費——待折扣進項稅額

    貸：相關(guān)科目

一般納稅人應(yīng)在“應(yīng)交稅費——應(yīng)交增值稅”二級科目下設(shè)置“進項稅額”、“已交稅金”、“減免稅款”、“出口抵減內(nèi)銷產(chǎn)品應(yīng)納稅額”、“轉(zhuǎn)出未交增值稅”、“銷項稅額”、“出口退額”、“進項稅額轉(zhuǎn)出”和“轉(zhuǎn)出多交增值稅”等三級科目，用于分別核算進項稅額、已交稅金、減免稅款、出口抵減內(nèi)銷產(chǎn)品應(yīng)納稅額、轉(zhuǎn)出未交增值稅、銷項稅額、出口退額、進項稅額轉(zhuǎn)出、轉(zhuǎn)出多交增值稅等業(yè)務(wù)的發(fā)生情況。