企業(yè)所得稅中的三項費用扣除標準是指：工資、薪金以及勞務報酬、社會保險費和住房公積金的扣除標準。具體計算方法如下：
1. 工資、薪金以及勞務報酬的扣除標準：按照企業(yè)工資、薪金以及勞務報酬總額的百分比計算。具體百分比標準如下：
- 年應納稅所得額不超過30萬元的，扣除標準為工資、薪金以及勞務報酬總額的50%；
- 年應納稅所得額超過30萬元的，扣除標準為工資、薪金以及勞務報酬總額的30%。
2. 社會保險費的扣除標準：按照企業(yè)實際繳納的社會保險費總額計算。具體標準如下：

- 企業(yè)實際繳納的社會保險費總額不超過工資、薪金以及勞務報酬總額的20%時，扣除標準為實際繳納的社會保險費總額；
- 企業(yè)實際繳納的社會保險費總額超過工資、薪金以及勞務報酬總額的20%時，扣除標準為工資、薪金以及勞務報酬總額的20%。

3. 住房公積金的扣除標準：按照企業(yè)實際繳納的住房公積金總額計算。具體標準如下：

- 企業(yè)實際繳納的住房公積金總額不超過工資、薪金以及勞務報酬總額的12%時，扣除標準為實際繳納的住房公積金總額；
- 企業(yè)實際繳納的住房公積金總額超過工資、薪金以及勞務報酬總額的12%時，扣除標準為工資、薪金以及勞務報酬總額的12%。

需要注意的是，以上三項費用扣除標準的計算都是基于企業(yè)實際發(fā)生的費用總額，且扣除標準的計算不能超過企業(yè)所得稅應納稅所得額的50%。