往來(lái)款項(xiàng)清查中，如果發(fā)現(xiàn)有爭(zhēng)議的款項(xiàng)，需要按照以下步驟處理：
1. 首先核實(shí)賬目，確認(rèn)爭(zhēng)議款項(xiàng)的真實(shí)性和存在性。
2. 如果確認(rèn)該款項(xiàng)確實(shí)存在爭(zhēng)議，需要及時(shí)與對(duì)方聯(lián)系溝通，了解對(duì)方的意見和要求。
3. 在溝通的基礎(chǔ)上，雙方應(yīng)盡量協(xié)商解決爭(zhēng)議，達(dá)成共識(shí)。
4. 如果無(wú)法協(xié)商解決，則需要進(jìn)行進(jìn)一步的調(diào)查和取證，包括查看相關(guān)合同、協(xié)議、憑證等，以確定款項(xiàng)的真實(shí)性和歸屬。
5. 最終，根據(jù)調(diào)查結(jié)果，確定爭(zhēng)議款項(xiàng)的處理方式，可以是調(diào)整賬目、追回款項(xiàng)、支付款項(xiàng)等。

需要注意的是，在處理爭(zhēng)議款項(xiàng)時(shí)，應(yīng)當(dāng)遵循公正、公平、合法的原則，確保處理結(jié)果合理、合法、公正。同時(shí)，應(yīng)當(dāng)及時(shí)記錄處理過程和結(jié)果，以備查證。